CytoFLEX基于APD的光纤二极管阵列检测器(FAPD)替代传统的光电倍增管检测器(PMT)，这一创新改变改善了信号分辨率，有助于获得准确的数据，提高弱荧光信号及小颗粒的检测水平。

波分复用检测(WDM)依靠光纤和带通滤片将不同波长的光分开，尽可能地减少光的折射及传导途径，提高检测效率。结合插拔式滤片设计，也让用户更易于换检测通道的带通滤片。

CytoFLEX先进的光学系统确保光信号的损失程度更低，结合24比特信号处理系统，使得其拥有16,777,216道数数据精度及7个数量级的动态显示范围（FITC<30MESF, PE<10MESF）。

CytoFLEX在各个荧光通道中检测8峰彩虹微球实验的结果，标明其不仅在常用荧光通道中有优秀表现，在紫光和远红外通道也表现突出。

CytoFLEX 流式细胞仪拥有的分辨率，足以检测小于 80nm 的粒子，并同时获得其表型表达信息。